（1）肾上腺皮质激素治疗：可用强的松口服治疗。有明确的疗效，可消炎，缓解自身免疫。总疗程2～3个月。不宜过久，以避免激素副作用的出现。
（2）甲状腺片：甲减或甲状腺功能正常者，亚甲炎反复发作者，或甲状腺肿大缩小不明显者，均可酌情加用甲状腺片口服，多数患者数周后可以治愈。甲状腺激素，可以缩小肿大的甲状腺，纠正或防止甲减，但要注意避免发生药源性甲亢的出现。应从小剂量开始，缓慢加量，药量递增间隔不要少于1周，并注意观察临床症状变化。肝肾功能不好及心脏病患者更应慎用。极少数患者因亚甲炎反复发作，导致甲减，此时则需要长期服用甲状腺素片替代治疗。
（3）解热止痛药：如果有发热，甲状腺疼痛，可选阿司匹林、消炎痛、保泰松等解热止痛片。
（4）由于此病有自限性，一般不需要用抗生素治疗，大多数能自行恢复。但甲状腺肿痛严重，发热也较重，与急性甲状腺炎难分辨者，也可以用广谱抗生素进行诊断或预防性治疗7～10日。
（5）β-受体阻滞剂：亚甲炎早期，甲亢症状明显，可给予心得安缓解心慌出汗等交感神经兴奋症状，症状缓解后逐渐减量至停用。但过敏体质、哮喘、糖尿病正在用降糖药物时、肝病患者等，应小剂量谨慎用药。
（6）抗甲状腺药物：亚甲炎甲亢，一般不用抗甲状腺药物。甲亢表现较重者，可酌情加用抗甲状腺的药物。如丙基硫氧嘧啶或他巴唑。当甲亢症状消失，甲状腺功能恢复正常后，要及时停药。
（7）其他：卧床休息，多饮水。疼痛剧烈可服流质饮食，颈部冷敷等。预防感冒，防止复发。复发后要及时治疗，不要拖延治疗。加强锻炼，增强体质。另外还要疏畅情志，保持情绪稳定，不要着急生气。
（8）注意监测甲状腺功能和甲状腺肿大的变化，及时调整用药及剂量。避免药物治疗的副作用发生。
（9）中医辨证治疗对于该病的治疗及预后皆有较好的效果，通过口服及外用中药可以有效改善发热、颈前胀痛及亚甲炎引起的甲亢相关症状。对不同患者四诊合参，制定合理有效的治疗方案。

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