多数甲减需要终生用甲状腺激素替代治疗。同时还要根据病因和并发症的不同，进行相应的对症处理。有贫血者可补充铁剂、维生素B  ₁₂   、叶酸等；胃酸不足者应补充稀盐酸等。但必须与甲状腺激素替代治疗同时进行，才能有效。
临床甲减激素替代治疗，所用甲状腺激素一般有四种制剂可以选择：
（1）干甲状腺片：是由家畜（猪、牛、羊）甲状腺的干燥粉末加工制成。价廉、易得，较为常用。一般每片含量40毫克。治疗甲减时应从小剂量开始。特别是甲减病情重或伴心血管疾病，或老年甲减患者，甲状腺片应当从10～20毫克（1/4或1/2片）/日开始，每日仅口服1次即可。以后每隔1～2周逐渐加量，1～2个月或更长时间增加至60～120毫克/日。增加剂量时，必须注意有无心脏方面的不良反应，比如胸闷、胸前区疼痛、心律失常，甚至心肌梗死等。有的患者当用药剂量过多时，还可以产生甲亢的症状。故必须个体化调整用药剂量。一般在服药1周左右开始出现利尿，体重下降。而甲减的其他表现的明显改善，及血清中T  ₃   、T  ₄   和TSH恢复正常，一般需要1.5～2个月的时间。
（2）左旋甲状腺素（L-T  ₄   ）片：又名优甲乐，即人工合成的左旋甲状腺素钠。此药口服吸收良好，作用时间长而稳定，但价格较贵。该作用缓慢而持久，对心脏的副作用小，药量也较易掌握。可用于甲减的替代治疗，也适用于甲减昏迷的救治。一般在服用后1周左右即可见疗效。服药后1个月疗效明显。L-T  ₄   在体内可转变为T  ₃   ，故血清中T  ₃   也可较高。每日口服1次即可，不必分次服。
（3）左旋三碘甲状腺原氨酸（L-T  ₃   ）：有片剂和针剂两种剂型。片剂口服吸收良好，除口服外，还可以针剂静脉给药。作用强而迅速，但易引起心绞痛、心律失常或循环衰竭。此药作用快，持续时间短，最适合用于黏液性水肿昏迷的抢救。因其作用时间短，需要日服药3次，不适合甲减的长期替代治疗。
（4）甲状腺素（T  ₄   ）和三碘甲状腺原氨酸（T  ₃   ）的混合制剂：二者按4：1的比例混合而成。其优点是近似人体内本身产生的甲状腺激素的比例。又比干甲状腺片成分纯，作用稳定。但一般药店及医院少有供应

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