手术治疗甲亢，术后主要并发症有：①由于甲亢患者甲状腺血流极其丰富和快速，术后大出血发生率高。迅速加大的血肿会出现对于呼吸道的压迫，严重者会发生窒息。故术后要有适当压迫止血措施。②手术牵拉、血管损伤或误切神经，会发生声音嘶哑、失音、呛咳等邻近神经损伤症状。③甲状旁腺受损或误切，可引起甲状旁腺功能暂时减低，可发生低血钙性抽搐，如果手术误切多个甲状旁腺，则会造成终身甲状旁腺功能减低。④甲亢患者术前准备不足，手术刺激可诱发甲状腺危象发生。主要表现有术后突发高热、烦躁不安、脉搏细弱等。有生命之危。⑤手术切除甲状腺组织过多，可导致终身甲减，需要终生服用甲状腺激素替代治疗。⑥有些导致甲状腺肿原因未除，如仍然碘吸收不足，或遗留甲状腺组织仍受甲状腺刺激物的刺激，手术后甲状腺肿大还有可能复发。
由于甲亢手术治疗可引起不少术后并发症，有些并发症还是比较严重的，不可逆的和终身性的。故选择手术治疗应持慎重态度。轻率手术治疗有可能造成终身遗憾。一些较小的无害的甲状腺肿块与手术的风险需要权衡利弊后，再做决定。

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