（1）感染：化脓性细菌感染可以直接引起急性化脓性甲状腺炎，临床较为少见。病毒可以启动自身免疫反应发生，可以成为一些甲状腺炎的可能诱发因素。
（2）自身免疫：多数甲状腺炎都不是细菌病毒直接感染引起的，甲状腺炎的发病大都与自身免疫有关。自身免疫是人体自身的某种组织（如甲状腺组织），由于外伤、感染、离子辐射、药物等因素发生了改变，成为自己身体的“异己分子”，产生了“抗原”效应，刺激身体产生特异性抗体，诱发人体免疫系统对甲状腺组织进行攻击和战斗，启动了一系列炎症反应的过程。这就是自身免疫反应，实际上是身体内部发生了敌我不分的内战，而非外来敌人（如细菌、病毒等）的直接攻击。容易发生自身免疫的人群，称易感人群。这种对自身免疫易感的体质特点，具有先天遗传性。慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本甲状腺炎）的发病就属于此种类型的疾病。
（3）物理化学及生物因素：外伤、烧伤等可以直接损伤甲状腺，引起炎症，进而合并细菌感染，发展成化脓性甲状腺炎。应用放射性碘治疗的患者，也可发生放射性甲状腺炎。

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