绝大部分（90%）临床甲减患者都是甲状腺性甲减。又称原发性甲减。此类甲减是由于甲状腺本身的病变，引起甲状腺激素分泌不足。如遗传基因缺陷、环境（缺碘、高碘、致甲状腺肿物质等）因素、各种甲状腺炎症或肿瘤等多种因素，都可造成甲状腺激素合成、分泌障碍，甲状腺滤泡被破坏和数量减少，使体内甲状腺激素产量不足，而引发临床甲减的发生。甲状腺性甲减患者的下丘脑—垂体轴并无病变。甲状腺性甲减的确诊指标是：T  ₃   （FT  ₃   ）↓、T  ₄   （FT  ₄   ）↓、TSH↑。
甲状腺性甲减，包括：①慢性甲状腺炎（桥本病）。②甲亢经放射性碘治疗或外科手术后（医源性）。③亚急性甲状腺炎（简称亚甲炎）。④先天性甲状腺素生成障碍。⑤异位甲状腺及甲状腺缺如。⑥长期缺碘（地甲减）或高碘（碘甲减）。⑦癌症及淀粉样变性对甲状腺的浸润破坏。⑧妊娠或出生后一时甲减。⑨甲亢药物治疗中，抗甲状腺药物的过度服用。⑩长期大量服用抗甲状腺物质（药物、食物及环境污染等）等，以上疾病均可引起甲减。成人甲减以桥本病甲减、医源性甲减和亚甲炎甲减较为多见。

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